Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STAG2Q8N3U4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STAG2Q8N3U4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STAG2Q8N3U4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms