Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLIP4Q8N3C7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP4Q8N3C7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIP4Q8N3C7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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