Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMYD4Q8IYR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD4Q8IYR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD4Q8IYR2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms