Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNTD2Q8IXW0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD2Q8IXW0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms