Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC65Q8IXS2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC65Q8IXS2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC65Q8IXS2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC65Q8IXS2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC65Q8IXS2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC65Q8IXS2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms