Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM42Q8IWZ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM42Q8IWZ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms