Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC50Q8IVM0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms