Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS6Q8IU80 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS6Q8IU80 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms