Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX32Q86XE0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX32Q86XE0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms