Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP8Q86W28 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP8Q86W28 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP8Q86W28 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms