Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACS2Q86VP3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PACS2Q86VP3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms