Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC84Q86UT8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC84Q86UT8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms