Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM2Q86SE8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM2Q86SE8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPM2Q86SE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms