Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBBP6Q7Z6E9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RBBP6Q7Z6E9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RBBP6Q7Z6E9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms