Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms