Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD3Q7Z3D4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD3Q7Z3D4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms