Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP54Q7Z3B4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP54Q7Z3B4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms