Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KCTD1Q719H9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCTD1Q719H9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCTD1Q719H9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms