Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PREX2Q70Z35 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PREX2Q70Z35 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms