Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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