Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWJ1

STXBP4, Syntaxin-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP4Q6ZWJ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STXBP4Q6ZWJ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STXBP4Q6ZWJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms