Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN12Q6ZSI9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN12Q6ZSI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN12Q6ZSI9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms