Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSTM1Q6UX27 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSTM1Q6UX27 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms