Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD1Q6UWL2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD1Q6UWL2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD1Q6UWL2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms