Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPE4Q6UWF7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms