Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC171Q6TFL3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC171Q6TFL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms