Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SAMD1Q6SPF0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SAMD1Q6SPF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms