Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms