Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM88Q6PEY1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms