Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMBQ6PCB8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMBQ6PCB8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms