Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLC3Q6P597 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLC3Q6P597 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms