Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFXN4Q6P4A7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms