Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDD2Q6NTF9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 502.6 ms