Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8EQ6NSJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8EQ6NSJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8EQ6NSJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC8EQ6NSJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC8EQ6NSJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms