Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4GALNT3Q6L9W6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4GALNT3Q6L9W6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4GALNT3Q6L9W6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
B4GALNT3Q6L9W6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4GALNT3Q6L9W6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms