Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf53Q5VUE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf53Q5VUE5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms