Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C12orf60Q5U649 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms