Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC18Q5T9S5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC18Q5T9S5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC18Q5T9S5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC18Q5T9S5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms