Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDLRAD1Q5T700 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LDLRAD1Q5T700 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms