Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNJQ5T5M9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNJQ5T5M9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNJQ5T5M9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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