Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T1

TMEM170B, Transmembrane protein 170B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170BQ5T4T1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM170BQ5T4T1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM170BQ5T4T1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms