Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZFYVE27Q5T4F4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFYVE27Q5T4F4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFYVE27Q5T4F4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms