Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRIF1Q5T3J3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIF1Q5T3J3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIF1Q5T3J3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms