Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIVEP3Q5T1R4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms