Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWA1

PPP1R15B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R15BQ5SWA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R15BQ5SWA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP1R15BQ5SWA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R15BQ5SWA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms