Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1Q5M775 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1Q5M775 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1Q5M775 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms