Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WDR44Q5JSH3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR44Q5JSH3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR44Q5JSH3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms