Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO48Q5FWF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO48Q5FWF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO48Q5FWF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO48Q5FWF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO48Q5FWF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO48Q5FWF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms