Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM61Q5EBN2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM61Q5EBN2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms