Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms